La Commenda di San Giovanni di Prè (Commanderie de Prè) fait partie d'un ensemble de bâtiments situés dans le quartier de Prè, près de la gare de Genova Principe.
Le cœur du corps architectural est constitué de deux églises de style roman, l'une sur l'autre, l'église supérieure étant toujours ouverte au culte encore aujourd'hui, et d'un bâtiment à deux étages, plus tard surélevé, qui servait d'hospice, initialement pour les pèlerins, les soldats et les marchands, puis pour les malades et les indigents de la ville.
Le début de la construction remonte à 1180, à la demande des Chevaliers de San Giovanni, un ordre chevaleresque né à l'époque des croisades et connu aujourd'hui sous le nom d'Ordre des Chevaliers de Malte. L'ordre exploitait un réseau dense de lieux d'accueil similaires dans toute l'Europe. Ici, à Gênes, leur présence était particulièrement significative, à l'endroit où se connectaient les « routes terrestres » (les routes commerciales et de pèlerinage reliant l'Europe à Gênes) et les « routes maritimes » (les routes reliant la ville à toute la Méditerranée).
Devenue au fil des siècles le siège de confréries, puis subdivisée en appartements, la Commanderie a retrouvé sa disposition d'origine après une importante restauration au cours du XXe siècle.
Entre 2009 et 2020, ces espaces ont abrité le Museoteatro della Commenda.